Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHCHD5Q9BSY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms