Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGIP1Q9BQI5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms