Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3GL3Q99963 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3GL3Q99963 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms