Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPN18Q99952 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN18Q99952 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN18Q99952 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms