Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC1Q99614 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms