Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP88Q99567 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP88Q99567 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP88Q99567 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms