Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms