Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC38A2Q96QD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC38A2Q96QD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms