Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMG1Q96Q15 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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