Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCEEQ96PE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCEEQ96PE7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCEEQ96PE7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms