Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC115Q96NT0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC115Q96NT0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms