Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCLT1Q96NL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCLT1Q96NL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms