Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF488Q96MN9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF488Q96MN9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF488Q96MN9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms