Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE3Q96MG7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms