Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF354BQ96LW1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms