Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX27Q96L92 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX27Q96L92 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX27Q96L92 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms