Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPGRIP1Q96KN7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPGRIP1Q96KN7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms