Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAX2Q96IS3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAX2Q96IS3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms