Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPNQ96H22 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms