Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF2Q96GP6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF2Q96GP6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARF2Q96GP6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms