Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD4

AURKB, Aurora kinase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKBQ96GD4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AURKBQ96GD4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AURKBQ96GD4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms