Protein–RNA interactions for Protein: Q96G97

BSCL2, Seipin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSCL2Q96G97 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BSCL2Q96G97 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BSCL2Q96G97 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BSCL2Q96G97 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms