Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDX11Q96FC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX11Q96FC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX11Q96FC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms