Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUS1Q96E22 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUS1Q96E22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUS1Q96E22 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms