Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCN3Q96D15 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RCN3Q96D15 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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