Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC124Q96CT7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC124Q96CT7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms