Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRAMD1AQ96CP6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRAMD1AQ96CP6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms