Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C12orf43Q96C57 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
C12orf43Q96C57 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C12orf43Q96C57 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms