Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VOPP1Q96AW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VOPP1Q96AW1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms