Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E2Q96A05 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP6V1E2Q96A05 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E2Q96A05 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms