Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFKQ969G6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFKQ969G6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms