Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS3Q969F9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS3Q969F9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms