Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF4BQ92750 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF4BQ92750 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms