Protein–RNA interactions for Protein: Q92523

CPT1B, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1BQ92523 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPT1BQ92523 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPT1BQ92523 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPT1BQ92523 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPT1BQ92523 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPT1BQ92523 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPT1BQ92523 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPT1BQ92523 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPT1BQ92523 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPT1BQ92523 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms