Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113Q902F9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113Q902F9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERVK_113Q902F9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms