Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY21

SORCS1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, humanhuman

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1Q8WY21 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORCS1Q8WY21 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORCS1Q8WY21 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms