Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms