Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJA4Q8WW22 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms