Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD4Q8WVF5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD4Q8WVF5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms