Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
BRK1Q8WUW1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BRK1Q8WUW1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms