Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM4

PDCD6IP, Programmed cell death 6-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6IPQ8WUM4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD6IPQ8WUM4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD6IPQ8WUM4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.6 ms