Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB2BQ8WUD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2BQ8WUD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms