Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP1Q8TDR0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP1Q8TDR0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms