Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK1Q8TDC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRSK1Q8TDC3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms