Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MDM1Q8TC05 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM1Q8TC05 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms