Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC148Q8NFR7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC148Q8NFR7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms