Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CNNM3Q8NE01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM3Q8NE01 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM3Q8NE01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
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