Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF169Q8NCN4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF169Q8NCN4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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