Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPRYD3Q8NCJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPRYD3Q8NCJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPRYD3Q8NCJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms