Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPC24Q8NBT2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms